主持课题：
1. Notch信号通路参与幽门螺杆菌感染诱导的CD4+T细胞分化成Th1细胞的调控作用
国家自然科学基金面上项目（编号81971903）,55万，2020/1-2023/12，主持人
2. 幽门螺杆菌 Lpp20抗原引起的免疫优势CD4+T细胞应答及与胃部疾病的相关性
国家自然科学基金面上项目（编号81470831），73万，2015/1-2018/12，主持人
3. 幽门螺杆菌 Lpp20 的H-2d 限制性Th 表位的鉴定及其免疫学特性的研究
国家自然科学基金面上项目（编号31070119），34万，2011/1-2013/12， 主持人
4. APC上的Jagged1配体与CD4+T细胞上的Notch1受体的信息交流在H.pylori感染过程中的作用
广东省自然科学基金自由申请项目（编号2023A1515010084），10万，2023/01-2025/12
5. 幽门螺杆菌Lpp20的H-2d限制性Th表位的免疫学特性的研究
广东省自然科学基金自由申请项目（编号S2011010006070），3万，2011/10-2013/10
6. 医疗器械临床试验服务平台（CRO模式）建设
广东省科技协同创新与平台环境建设（编号2015A040404021），50,2015/1-2017/12，主持人
参与课题：
1. 基于人工染色体的异源免疫表达与调控
科技部国家重点研发计划（编号2019YFA0903802），849万，2020/1-2024/12
2. 蛋白质功能分析试剂国产化（2/33）
国家高技术研究发展计划“863”项目（编号2014AA020909），500万，2014/1-2016/12
3. 血清淀粉样蛋白P物质对高密度脂蛋白功能及巨噬细胞活化的影响及其与AS发生中的机制研究（2/9）
国家自然科学基金面上项目（编号81370380），70万元，2014/1-2017/12
4. 氧化应激导致2型糖尿病大血管损伤的机制研究（4/33）
国家重点基础研究发展计划“973”项目（编号2011CB504006）， 196.7万，2011/1-2015/12
5. 肠道内分泌L细胞和胰腺β细胞协同调控血糖的研究（2/7）
高等学校博士学科点专项科研基金(编号20104433110014)，6万元，2011/1-2013/12
6. SAP对HDL及巨噬细胞功能的影响及其在AS发生中的机制研究（2/9）
广东省自然科学基金面上项目 （编号S2013010014739），5万元，2013/10-2015/10
7. 热休克蛋白65（HSP65）活化T淋巴细胞免疫对HDL功能影响的分子机制（2/10）
广州市科技计划（编号1563000242），20万元，2015/6-2018/5
8. T细胞受体（TCR）-ZAP70信号通路在HSP65诱导HDL功能减退中的机制研究（2/10）
广东省教育厅普通高校省级重大科研项目（自然科学类2014KZDXM020），12万元，2014/9-2017/8
9. anti-VEGF单克隆抗体的临床研究
广州市产学研协同创新重大专项（201604010057）2015.4.1-2018.3.31，200万
10. 广东省新型研发机构建设项目（3/15）
广东省科技计划项目（编号2016B090919019），2016/1-2018/12，200万
11. 珠海南医大生物医药公共服务平台（3/9）
广东省科技计划项目-创新载体建设项目（编号2013B090800036），2014/3-2017/2，20万元
12. 生物医药公共服务平台（8/11）
广东省经济与信息化项目-广东省现代服务业发展引导专项基金， 2013/1-2015/12，100万元
13. 深圳市科技计划：基于新生儿晚发性感染的病原体检测技术研究（No.20160429102107), 2016/1-2020/12,60万，参加
14. 重大疾病（恶性肿瘤）分子分型和个体化诊疗创新平台建设及产品开发研究 （3/10）
佛山市产学研专项项目（2011BC100011），2011/1-2013/12，20万元
15. 特异针对EGFRvIII的核酸适配子的体外筛选及其活性鉴定（3/9）
国家自然科学基金面上项目（编号30500608），2006/1-2008/12，25万元
16. 一种β-Tm新异型体与FHC相关突变体hcTnT(R92w)相互作用的生物功能研究（4/4）
国家自然科学基金面上项目（编号30571022），2006/1-2008/12，23万元
17. 肝脏疾病相关蛋白单克隆抗体库的构建和应用（8/22）
国家科技攻关计划(编号2004BA711A20)，2004/10-2005/12，132.5万
18. 蛋白质组学领域中的抗体技术与应用 （8/11）
国家重点基础研究发展计划（973计划）（编号2001CB510208），2004/10-2005/12，70万元
19. 不同反应性抗体分子产生机制的初步研究（2/8）
广东省自然科学基金(编号5004750)， 2005/1-2006/8，5万元
20. 肿瘤相关抗原抗体芯片及乙肝多表位疫苗的制备研究（4/10）
广州市科技攻关重点项目（编号2003Z2-E0261），2003/9-2004/12，70万元，
21. 肿瘤相关抗原单克隆抗体群的建立及抗体芯片制备的研究（3/8）
广州市科技攻关重点项目（编号2003Z2-E0262），2003/9-2004/12，50万元
22. 蛋白质领域中的抗体技术与应用（6/10）
广州市科技攻关项目 （编号2001CB510208），2005/1-2007/12，4万
23. 肝脏疾病相关蛋白单克隆抗体库的构建和应用（9/10）
广州市科技攻关项目(编号005Z3-C7511)，2004/10-2005/12，36万
发表论文：
1. Ye J, Liu Q, He Y, Song Z, Lin B, Hu Z, Hu J, Ning Y, Cai C, Li Y*. Combined therapies of CAR-IL-15/IL-15Rα-T cells and GLIPR1 knockdown in cancer cells enhanced anti-tumor effect against gastric cancer. J Transl Med. 2024，22 (1):171. doi: 10.1186/s12967-024-04982-6.
2. Liu Q, Chen C, He Y, Mai W, Ruan S, Ning Y, Li Y*. Notch signaling regulates the function and phenotype of dendritic cells in Helicobacter pylori infection. Microorganisms, 2023, 11：2818. . doi: 10.3390/microorganisms11112818.
3. Ren Y, Li R, Feng H, Xie J, Gao L, Chu S, Li Y*, Meng F, Ning Y. Single-cell sequencing reveals effects of chemotherapy on the immune landscape and TCR/BCR clonal expansion in a relapsed ovarian cancer patient. Front Immunol, 2022， 13:985187， doi: 10.3389/fimmu.2022.985187
4. Ye J, Wen J, Wu D， Hu B，Luo M， Lin Y， Ning L, Ning Y, Li Y*. Elevated DLL3 in stomach cancer by tumor-associated macrophages enhances cancer cell proliferation and cytokine secretion of macrophage. Gastroenterology report, 2022:10:goab052. DOI: 10.1093/gastro/goab052.
5. Wen J，Chen C, Luo M，Liu X, Guo J, Wei T, Gu X, Gu S, Ning Y, Li Y*. Notch signaling ligand Jagged1 enhances macrophage-mediated response to Helicobacter pylori. Front Microbiol.2021,12:692832.DOI: 10.3389/fmicb.2021.692832
6. Xie J, Wen J， Chen C, Luo M， Hu B， Wu D， Ye J， Lin Y， Ning L, Ning Y, Li Y*. Notch 1 is involved in CD4+ T cells differentiation into Th1 subtype during Helicobacter pylo4ri infection. Front Cell Infect Microbiol 2020,10: 575271. DOI: 10.3389/fcimb.2020.575271.
7. Lin Y, Ye J, Luo M，Hu B, Wu D, Wen J, Yang C, Li Y*. Ning Y. Group B Streptococcus DNA copy numbers measured by digital PCR correlates with perinatal outcomes. Anal Chem. 2019, 91(15): 9466-9471. DOI: 10.3389/fcimb.2020.575271.
8. Ning Y, Ye J, Wen J, Wu D, Chen Z, Lin Y, Hu B, Luo M, Luo J，Ning L, Li Y*.Identification of two Lpp20 CD4+ T cell epitopes in helicobacter pylori-infected subjects. Front. Microbiol，2018, 9：884. DOI: 10.3389/fmicb.2018.00884.
9. Ye J, Wen J, Ning Y, Li Y*. High notch expression implies poor survival in pancreatic ductal adenocarcinoma: A systematic review and meta-analysis. Pancreatology, 2018, 18（8）：954-961. DOI: 10.1016/j.pan.2018.09.014.
10. Li Y, Ye J, Chen Z, Wen J, Li F, Su P, Lin Y, Hu B, Wu D, Ning L, Xue Q, Gu H, Ning Y. Annonaceous acetogenins mediated up-regulation of Notch2 exerts growth inhibition in human gastric cancer cells in vitro. Oncotarget, 2017, 8(13):21140-21152. DOI: 10.18632/oncotarget.15502.
11. Li Y, Chen Z, Ye J, Ning L, Luo J, Zhang Li, Jiang Y, Xi Y, Ning Y. Antibody production and Th1-biased response induced by an epitope vaccine composed of cholera toxin B unit and Helicobacter pylori Lpp20 epitopes. Helicobacter, 2016, 21（3）：234-48. DOI: 10.1111/hel.12268.
12. Li Y, Hao H, Zhou M, Zhou H, Ye J, Ning L, Ning Y. Intron Ⅴ, not intronⅠof human thrombopoietin, improves expression in the milk of transgenic mice regulated by goat beta-casein promoter. Sci Report, 2015，5:16051. DOI: 10.1038/srep16051
13. Li Y, Zhou M, Zhou H, Ning Y. The last intron of the human thrombopoietin gene enhances expression in milk of transgenic mice. Funct Integr Genomics. 2014, 14(1):229-36. DOI: 10.1007/s10142-013-0348-x.
14. Li Y, Jiang Y, Xi Y, Zhang L, Luo J, He D, Zeng S,Ning Y.Identification and characterization of H-2d restricted CD4+ T cell epitopes on Lpp20 of Helicobacter pylori. BMC Immunology, 2012, 13(1):68. DOI: 10.1186/1471-2172-13-68.
15. Li Y, Ning Y, Wang Y, Peng D, Jiang Y, Zhang L, Long M, Luo J, Li M. Mimotopes selected with a neutralizing antibody against urease B from Helicobacter pylori induce enzyme inhibitory antibodies in mice upon vaccination. BMC Biotechnology, 2010, 10:84. DOI: 10.1186/1472-6750-10-84.
16. Li Y, Ning YS, Wang YD, Luo J, Wang W, Dong WQ, Li M. Production of mouse monoclonal antibodies against Helicobacter pylori Catalase and mapping the antigenic epitope by phage display library. Vaccine, 2008, 26(9): 1263-1269. DOI: 10.1016/j.vaccine.2007.11.055.
17. Li Y, Ning YS, Wang YD, Hong YH, Luo J, Dong WQ, Li M. Production of Mouse Monoclonal Antibodies against Helicobacter pylori Lpp20 and Mapping the Antigenic Epitope by Phage Display Library. Journal of Immunological Methods，2007，325 （1-2）：1-8. DOI: 10.1016/j.jim.2007.05.005.
18. Lê KA, Li Y(共同第一), Xu X, Yang W, Liu T, Zhao X, Tang YG, Cai D, Go VL, Pandol S, Hui H. Alterations in Fecal Lactobacillus and Bifidobacterium Species in Type 2 Diabetic Patients in Southern China Population. Front Physiol. 2013，3:496. DOI: 10.3389/fphys.2012.00496