南方医科大学皮肤病医院（原广东省皮肤病医院）副研究员。2010年获华南农业大学生物技术学士学位，2012年至2018年在香港中文大学医学院获硕士、博士学位。曾供职于深圳华大基因研究院和香港中文大学化学病理系，从事生物医学研究，在Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、Nature Communication和Aging Cell等学术期刊发表论文多篇。目前负责南方医科大学皮肤病医院生物信息平台建设及相关课题研究。课题组善于发挥生物信息分析的优势，结合分子生化实验研究非编码区域的功能及其作用机制。

       欢迎对生物信息学、分子生物学或生物医学有浓厚兴趣的同学加入课题组，共同探索基因组非编码区域的功能。请感兴趣的同学将个人简介（CV）发送至邮箱 zhoujj2013@smu.edu.com 。

主要研究方向：

1. 以高通量数据分析和算法开发为驱动的生物医学研究；

2. 长链非编码RNA（lncRNA）和增强子（enhancer）元件在基因表达调控过程中的功能及作用机制；

3. 非编码调控元件在维持表皮干细胞稳态的功能及作用机制。

代表论文：

Li, Z., Li, X., Lin, J., Wang, Y., Cao, H.*, Zhou, J.* (2024). Reevaluation by the CRISPR/Cas9 knockout approach revealed that multiple pluripotency-associated lncRNAs are dispensable for pluripotency maintenance while Snora73a/b is essential for pluripotency exit. Science China Life Sciences, 1-15.

Lin, Y.^#, Zhang, Y.^#, Sun, H., Jiang, H., Zhao, X., Teng, X., Lin, J., Shu, B., Sun, H., Liao, Y.*, Zhou, J.* (2024). NanoDeep: a deep learning framework for nanopore adaptive sampling on microbial sequencing. Briefings in Bioinformatics, bbad499.

Zhang, Y.^#, Shi, Y.^#, Lin, J., Li, X., Bin, Y.*, Zhou, J.* (2021). Immune cell infiltration analysis demonstrates excessive mast cell activation in psoriasis. Frontiers in Immunology, 4941.

Huang, H.^#, Hu, Y.^#, Huang, G., Ma, S., Feng, J., Wang, D., Lin, Y.*, Zhou, J.* and Rong, Z.* (2021) Tag-seq: a convenient and scalable method for genome-wide specificity assessment of CRISPR/Cas nucleases. Communications biology, 4(1), pp.1-8.

Li, X.^#, Lin, J., Hu, Y., Zhou J.* (2020) PARMAP: A Pan-Genome-Based Computational Framework for Predicting Antimicrobial Resistance. Frontiers in microbiology 11.

Zhou, J.^#, So, K.K.^#, Li, Y.^#, Yuan, J., Ding, Y, Chen, F., Huang, Y., Sun, H.* , and Wang, H.* (2019) Elevated H3K27ac in aged skeletal muscle tissue drives a fibrogenic conversion of muscle satellite cells. Aging cell, 18(5), e12996.

Zhao, Y.^#, Zhou, J.^#, He, L., Sun, H.* , Wang, H.* (2019) MyoD induced enhancer RNA interacts with hnRNPL protein via CAAA motif to activate target gene transcription during myogenic differentiation. Nature Communications, 10(1) (2019): 1-17.

Zhou, J.^#, Huang, Y., Ding, Y., Yuan, J., Wang, H.* , Sun, H.* (2018). lncFunTK: A toolkit for functional annotation of long noncoding RNAs. Bioinformatics, 1, p2.

Zhou, J.^#, Zhang, S.^#, Wang, H.* , and Sun, H.* (2017). LncFunNet: an integrated computational framework for identification of functional long noncoding RNAs in mouse skeletal muscle cells. Nucleic Acids Res 45, e108–e108.

在研课题：

1. 老年人群新发传染病精准防治新技术与新策略转化应用研究（子课题2），参与，60万，2023-2026；

2. 新、突发重大传染病病原体发现、溯源及智能预警预测系统研发，参与，400万，2022-2024；

3. 衰老过程中增强子调控细胞外基质（ECM）重塑影响表皮干细胞稳态的分子机制研究，主持，58万，2021-2024；

4. RNA结合蛋白介导长链非编码RNA亚细胞定位的机制研究，主持，25万，2020-2022；

5. 南方医科大学皮肤病医院人才启动基金，主持，50万，2019-2023；