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更新日期：2025年9月25日
姓 名 荣知立 性 别 男
民 族 汉族 导师层次 博士导师
技术职称 教授 导师类型 学术型
最后学历 博士研究生毕业 最后学位 理学博士学位
行政职务 所长 Email rongzhili@smu.edu.cn
工作单位 南方医科大学 邮政编码 510515
跨学科招生 是
跨学科招生专业1 分子医学 招生层次类型1 学术学位博导
跨学科招生专业2 生物与医药 招生层次类型2 专业学位博导
个人简介

荣知立教授，博士生导师，海外高层次人才青年计划专家，南方医科大学肿瘤研究所所长，南方医科大学皮肤病医院皮肤病研究所所长，多器官损伤防治全国重点实验室PI。研究方向为基因编辑新技术研发以及利用小鼠模型、人源类器官和患者样本，研究肺和皮肤的再生医学。以第一作者或通讯作者在Cell Stem Cell, Nat Commun (3篇), Genome Biol,  Nucleic Acids Res (3篇), Cell Res, Adv Sci, Cell Rep 等学术期刊发表论文40余篇，3篇入选ESI高被引论文 (Top 1%)；受邀参与撰写基因编辑专著1部（剑桥大学出版社），申请国际PCT专利2项，美国专利1项，欧盟专利1项，中国发明专利10项（授权9项）；现任中国细胞生物学学会干细胞生物学分会专业委员会委员，中国遗传学会基因组编辑分会专业委员会委员，广东省呼吸与健康学会干细胞与再生医学专业委员会委员，曾任国际SCI期刊 Journal of Gene Medicine副主编，先后主持与参与国家重大科技项目、国家重点研发专项、国家自然科学基金以及广东省和广州市等项目。

研究领域

基因编辑技术开发、干细胞与肺再生医学。

通过AI辅助设计、结构指导等理性设计以及定向进化等方法，开发更适于疾病治疗的基因编辑新技术；结合临床样本、条件性基因编辑小鼠、人与小鼠气道类器官和肺泡类器官以及细胞模型等，研究气道及肺泡成体干细胞在肺损伤修复及肺纤维化中的命运转变及功能机制。

个人成果

    代  表  性  论  文                                                                                                                 

  1. Ma, S.#, Liao, K.#, Chen, K., Cheng, T., Yang, X., Chen, P., Li, S., Li, M., Zhang, X., Zhang, Y., Huang, T., Wang, X., Wang, L., Lin, Y., Rong, Z.* hpCasMINI: An engineered hypercompact CRISPR-Cas12f system with boosted gene editing activity. Nat Commun 16, 5001 (2025)
     
  2. Zhang, X.#, Li, M.#, Chen, K., Liu, Y., Liu, J., Wang, J., Huang, H., Zhang, Y., Huang, T., Ma, S., Liao, K., Zhou, J., Wang, M., Lin, Y.*, Rong, Z.*  Engineered circular guide RNAs enhance miniature CRISPR/Cas12f-based gene activation and adenine base editing. Nat Commun  16, 3016 (2025)
     
  3. Huang, T.#, Chen, S.#, Ding, K.#, Yuan, L., Lv, W., Chen, K., Liu, Y., Ma, D., Zhang, X., Wang, X., Luo, G., Yang, B.*, Lin, Y.*, Rong, Z.* METTL3/ALKBH5-mediated N6-methyladenosine modification drives macrophage M1 polarization via the Slc15a3-TASL-IRF5 signaling axis in psoriasis. Adv Sci (Weinh) e01408 (2025) 
     
  4. Zhang, X. #, Wang, X. #, Lv, J., Huang, H., Wang, J., Zhuo, M., Tan, Z., Huang, G., Liu, J., Liu, Y., Li, M., Lin, Q., Li, L., Ma, S., Huang, T., Lin, Y. *, Zhao, X. *, Rong, Z.* Engineered circular guide RNAs boost CRISPR/Cas12a- and CRISPR/Cas13d-based DNA and RNA editing. Genome Biol 24, 145 (2023)
     
  5. Zhao, S. #, Wu, X.#, Tan, Z., Ren, Y., Li, L., Ou, J., Lin, Y., Song, H., Feng, L., Seto, D., Wu, J., Zhang, Q.*, Rong, Z.* Generation of human embryonic stem cell-derived lung organoids for modeling infection and replication differences between human adenovirus types 3 and 55 and evaluating potential antiviral drugs. J Virol 97, e0020923 (2023)
     
  6. Ma, S., Liao, K., Li, M., Wang, X., Lv, J., Zhang, X., Huang, H., Li, L., Huang, T., Guo, X.*, Lin, Y.*, Rong, Z.* Phase-separated DropCRISPRa platform for efficient gene activation in mammalian cells and mice. Nucleic Acids Res 51,  5271-5284 (2023)
     
  7. Xu, Y. *, #, Zhang, J. #, Hu, Y. #, Li, X. #, Sun, L., Peng, Y., Sun, Y., Liu, B., Bian, Z. *, Rong, Z. * Single-cell transcriptome analysis reveals the dynamics of human immune cells during early fetal skin development. Cell Rep 36, 109524 (2021)
     
  8. Deng, C.C. #, Hu, Y.F. #, Zhu, D.H. #, Cheng, Q., Gu, J.J., Feng, Q.L., Zhang, L.X., Xu, Y.P., Wang, D., Rong, Z.*, Yang, B.* Single-cell RNA-seq reveals fibroblast heterogeneity and increased mesenchymal fibroblasts in human fibrotic skin diseases. Nat Commun 12, 3709 (2021)
     
  9. Zhang, X.#, Lv, S.#, Luo, Z.#, Hu, Y., Peng, X., Lv, J., Zhao, S., Feng, J., Huang, G., Wan, Q.L., Liu, J., Huang, H., Luan, B., Wang, D., Zhao, X., Lin, Y., Zhou, Q.*, Zhang, Z.N.*, Rong, Z.* MiniCAFE, a CRISPR/Cas9-based compact and potent transcriptional activator, elicits gene expression in vivo. Nucleic Acids Res 49, 4171-4185 (2021)
     
  10. Ma, S., Wang, X., Hu, Y., Lv, J., Liu, C., Liao, K., Guo, X., Wang, D., Lin, Y.*, Rong, Z.* Enhancing site-specific DNA integration by a Cas9 nuclease fused with a DNA donor-binding domain. Nucleic Acids Res 48, 10590-10601 (2020)
     
  11. Rong, Z., Wang, M., Hu, Z., Stradner, M., Zhu, S., Kong, H., Yi, H., Goldrath, A., Yang, Y.G., Xu, Y., Fu, X. An effective approach to prevent immune rejection of human ESC-derived allografts. Cell Stem Cell 14, 121-130 (2014)
    Commented by Cell Stem Cell (14: 3)
    Reported by Fox News, China Daily, Science Daily, Medical news today, and UT San Diego et al.

 

    授 权 发 明 专 利      

  1. 中国发明专利：荣知立，林瑛，张鑫，彭欣；基于CjCas9和VPR核心结构域的融合蛋白、相应的DNA靶向激活系统及其应用，专利号：ZL 2019 1 0687464.7，专利申请日：2019年07月29日，授权公告日：2021年04月06日，授权公告号：CN 110358753 B
     
  2. 中国发明专利：荣知立，林瑛，马淑凤，王新龙，吕杰，刘成芳；一种高效精准靶向的基因整合系统及其应用，专利号：ZL 2019 1 0628110.5，专利申请日：2019年07月12日，授权公告日：2021年08月20日，授权公告号：CN 110305908 B

     
  3. 中国发明专利：荣知立，林瑛，黄洪新，单琳；一种高保真CRISPR/AsCpf1突变体的构建及其应用，专利号：ZL 2019 1 0766124.3，专利申请日：2019年08月19日，授权公告日：2021年09月07日，授权公告号：CN 110452893 B

     
  4. 中国发明专利：荣知立，林瑛，黄洪新，杨鸿程；新型SynNotch合成受体及编码基因，专利号：ZL 2018 1 0954811.3，专利申请日：2018年08月21日，授权公告日：2021年12月28日，授权公告号：CN 109180805 B

     
  5. 中国发明专利：荣知立，林瑛，黄洪新，周家健；一种检测脱靶效应方法及其应用，专利号：ZL 2020 1 1069812.3，专利申请日：2020年09月30日，授权公告日：2022年07月01日，授权公告号：CN 112159838 B

     
  6. 中国发明专利：荣知立，马淑凤，林瑛，廖凯彤，李梦绕；DropCRISPRa高效靶向相分离基因激活系统及其构建方法和应用；专利号：ZL 2022 1 0519955.2，专利申请日：2022年05月13日，授权公告日：2024年03月01日，授权公告号：CN 114958910 B

 

    专 业 论 著     

  1. Genome Editing and Engineering: From TALENs, ZFNs and CRISPRs to Molecular Surgery. Cambridge University Press. (2018). ISBN: 9781107170377
    Chapter 18: Genome editing of pluripotent stem cells. 
    Zhili Rong & Yang Xu