主要研究方向为牙髓及根尖周疾病免疫调控机制、口腔感染性疾病防治、牙髓再生分子机制及临床转化研究。具体如下：

1. 程序性细胞坏死在牙髓根尖周病中的作用研究：长期以来凋亡被认为是唯一的程序性细胞死亡方式，而坏死是一种由物理、化学刺激导致的细胞“意外性”死亡方式。然而，近期研究发现了一类可以在基因水平被调控的，但在形态学上类似于坏死的独特的细胞死亡方式--程序性细胞坏死，主要包括necroptosis、pyroptosis、NETosis等。它们在炎症性疾病的发病过程中发挥重要的作用，也因此成为近年来的研究热点。牙髓根尖周病是以细菌感染为主所致的炎症性疾病，研究程序性细胞坏死在牙髓根尖周病中的作用不仅可以进一步明确牙髓根尖周病的发病机理，而且可以为牙髓根尖周病的治疗提供新的靶点和思路。

2. 抗菌肽在龋病、根管感染防治中的应用研究：抗生素耐药性问题突出，抗菌肽（AMP）以其高效、不易形成耐药等特性受到关注。课题组通过计算机辅助设计，并筛选获得既能依靠静电作用作用于细菌细胞膜，又特异性靶向抑制抗坏血酸特异性 PTS 相关蛋白（PtxA/PtxB），抑制S. mutans抗坏血酸代谢的短链AMP（C10-KKWW）。此外，还选择了口腔共生菌乳酸杆菌拮抗S. mutans等致龋菌时分泌的Reuterin 6和Gassericin A，以及人唾液来源的Hastatin5的类似物Dhvar4为模板，根据不同的结构理念对其进行改造优化，合成了一系列有利于临床转化的抗 S. mutans 的肽类药物。同时，粪肠球菌是难治性根尖周炎的代表性致病菌，难以被传统抗菌治疗杀灭，导致持续感染，引起组织损伤，课题组以Epinecidin-1为模板，成功建立合成新型抗粪肠球菌抗菌肽，具有重要的临床意义以及临床转化潜力。

3. 牙髓再生分子调控机制以及相关临床转化研究：基于组织工程的概念，“再生牙髓学（regenerative endodontics）”以干细胞、生物支架、生物活性生长因子三位一体为基本理念，一直是牙髓病学领域的研究热点。课题组一直致力于牙髓干细胞成牙本质向分化、牙髓-牙本质复合体再生方面的基础研究，并主持开展多中心随机对照临床试验，探索基于注射型富血小板纤维蛋白（i-PRF）的再生性牙髓治疗在牙髓坏死成熟恒牙中的疗效，相关项目已受到校级、院级临床研究启动计划重点项目资助支持。

代表性论文：

1. Ma R, Deng Z, Du Q, Dai M, Luo Y, Liang Y, Dai X, Guo S, Zhao W*. Enterococcus faecalis Extracellular Vesicles Promote Apical Periodontitis. J Dent Res, 2024 Jun;103(6):672-682.

2. Dai X, Liang R, Dai M, Li X, Zhao W*. Smoking Impacts Alzheimer's Disease Progression Through Oral Microbiota  Modulation. Mol Neurobiol. 2024 May 25.

3. Huang W, Liu Z, Li Z, Meng S, Huang Y, Gao M, Zhong N, Zeng S, Wang L, Zhao W*. Identification of Immune Infiltration and Iron Metabolism-Related Subgroups in  Autism Spectrum Disorder. J Mol Neurosci, 2024,74(1):12.

4. Dai X, Ma R, Jiang W, Deng Z, Chen L, Liang Y, Shao L, Zhao W*. Enterococcus faecalis-Induced Macrophage Necroptosis Promotes Refractory Apical Periodontitis. Microbiol Spectr. 2022 Aug 31;10(4):e0104522. 

5. Jiang W, Deng Z, Dai X, Zhao W*. PANoptosis: a new insight into oral infectious diseases. Front Immunol, 2021, 12: 789610.

6. Deng Z, Lin B, Liu F, Zhao W*. Role of Enterococcus faecalis in refractory apical periodontitis: from pathogenicity to host cell response. J Oral Microbiol. 2023 Mar 1;15(1):2184924.

7. Dai X#, Deng Z#, Liang Y, Chen L, Jiang W, Zhao W*. Enterococcus faecalis induces necroptosis in human osteoblastic MG63 cells through the RIPK3 / MLKL signalling pathway. Int Endod J. 2020;53(9):1204-1215.

8. Deng Z, Yan W, Dai X, Chen M, Qu Q, Wu B*, Zhao W*. N-Cadherin Regulates the Odontogenic Differentiation of Dental Pulp Stem Cells via β-Catenin Activity. Front Cell Dev Biol. 2021;9:661116.

9. Liang Y#, Ma R#, Chen L, Dai X, Zuo S, Jiang W, Hu N, Deng Z*, Zhao W*. Efficacy of i-PRF in regenerative endodontics therapy for mature permanent teeth with pulp necrosis: study protocol for a multicentre randomised controlled trial. Trials. 2021;22(1):436. 

10. Liang J, Liang D, Liang Y, He J, Zuo S, Zhao W*. Effects of a derivative of reutericin 6 and gassericin A on the biofilm of Streptococcus mutans in vitro and cariesprevention in vivo. Odontology. 2021;109(1):53-66.

11. Liang D, Li H, Xu X, Liang J, Dai X, Zhao W*. Rational design of peptides with enhanced antimicrobial and anti-biofilm activities against cariogenic bacterium Streptococcus mutans. Chem Biol Drug Des. 2019;94(4):1768-1781.

12. Xie J, Li Q, Zhu XH, Gao Y, Zhao W*. IGF2BP1 promotes LPS-induced NFκB activation and pro-inflammatory cytokines production in human macrophages and monocytes. Biochem Biophys Res Commun. 2019;513(4):820-826.

13. Li H, Liang D, Hu N, Dai X, He J, Zhuang H, Zhao W*. Helicobacter pylori inhibited cell proliferation in human periodontal ligament fibroblasts through the Cdc25C/CDK1/cyclinB1 signaling cascade. J Periodontal Implant Sci. 2019;49(3):138-147.

14. Zhuang H#, Liang Y#, Xiang S, Li H, Dai X, Zhao W*. Dentinal tubule occlusion using Er:YAG Laser: an in vitro study. J Appl Oral Sci. 2021;29:e20200266. 

15. Zeng S, Fang Y, Zhang Q, Peng B, Zhang Z*, Zhao W*, Ge L*. Effect of basic fibroblast growth factor on the gingiva-derived mesenchymal stem cells. Int J Clin Exp Med. 2019, 12(5): 6347-6356. 

16. Liang Y, Deng Z, Dai X, Tian J, Zhao W*. Micro-invasive interventions for managing non-cavitated proximal caries of different depths: a systematic review and metaanalysis. Clin Oral Investig. 2018;22(8):2675-2684.

17. Xiang S, Shao J, He J, Wu XY, Xu X, Zhao W*. A Membrane-Targeted Peptide Inhibiting PtxA of Phosphotransferase System Blocks Streptococcus mutans. Caries Res. 2019;53(2):176-193.

18. Zhang H, Hatoko M, Yin D, Yang Y, Zeng Y, Komasa S, Kusumoto T, Nishizaki H, Shimizu H, Zhao W*, Okazaki J. Antibacterial activity and biocompatibility of nanoporous titanium doped with silver nanoparticles and coated with N-Acetylcysteine. J Hard Tissue Biol. 2018, 27(4): 351-358. 

代表性科研项目：

1. 项目负责人. 国家自然科学基金（面上项目）. 课题名称: GRHL2/FABP4调控mtDNA释放介导巨噬细胞necroptosis在粪肠球菌致难治性根尖周炎中的机制研究. 课题编号：82270965. 起止时间：2023.01.01-2026.12.31

2. 项目负责人. 广东省自然科学基金（面上项目）. 课题名称: NOD2介导内质网应激在粪肠球菌胞外囊泡抑制难治性根尖周炎骨愈合中的作用机制. 课题编号：2414050001917. 起止时间：2024.01.01-2026.12.31

3. 项目负责人.广州市科技计划项目（重点研发计划）. 课题名称: 载FI-3活性肽的可注射型富血小板纤维蛋白在牙髓再生中的研究与应用. 课题编号：2023B03J1253. 起止时间：2023.04.01-2026.03.31

4. 项目负责人. 广东省自然科学基金（面上项目）. 课题名称: mtDNA-ZBP1介导巨噬细胞necroptosis在粪肠球菌感染致难治性根尖周炎中的机制研究. 课题编号：2022A1515012169. 起止时间：2022.01.01-2024.12.31

5. 项目负责人. 广东省卫生健康适宜技术推广项目. 课题名称: 渗透树脂技术治疗早期龋的临床规范化操作及应用推广. 课题编号：202107011630274656.  起止时间：2021.09.01-2023.08.31

6. 项目负责人. 广东省自然科学基金（重点项目）. 课题名称: 靶向变异链球菌表面选择性受体及其毒力因子的复合抗菌肽的防龋作用及机制研究. 课题编号：2018B030311047. 起止时间：2018.05.01-2021.04.30

7. 项目负责人. 广州市科技计划项目. 课题名称: 特异性靶向变异链球菌的复合抗菌肽的防龋作用研究. 课题编号：201804010419. 起止时间：2018.04.01-2021.03.31